Однією із загадок Чорного моря є сірководневе зараження. Відкриття цього явища було зроблено в процесі океанографічної експедиції в 1896 році геологом Миколою Андрусовим. Досі наука займається вивченням причин і обставин насичення глибинних вод Чорного моря високою концентрацією водню. Поки що побутують дві версії: або сірководень виходить з глибоких морських тріщин або маленьких западин, або надходить у воду у зв'язку зі специфічними діями морських бактерій. Рівень сірководню підвищується вже на глибині ста метрів.

У зв'язку з великою кількістю сірководню в Чорному морі деякі дослідники стурбовані загрозою підводного вибуху, а деякі вважають, що море може навіть спалахнути.

Подібне на Чорному морі спостерігалося у вересні 1927 року, коли під час землетрусу загорілося саме море.