Мул має важливе значення в розвитку життя водойми. Мул в нього потрапляє з водозбірної площі під час весняних паводків, зливових дощів, а також внаслідок відмирання водної рослинності і тваринного населення водойм і продуктів їх життєдіяльності. Шар мулу завтовшки 30-40 см корисний у тому випадку, коли він містить легко-і швидкомінералізуючі органічні речовини. Якщо ж мул складається з товстого шару грубих залишків рослинності, які повільно розкладаються, то він може виділяти у воду шкідливі для риби гази (метан та ін.)
При значній товщині мулистих відкладень кисень не може проникати в глибокі шари води. Це призводить до закисання водойми, заростання її різними водними рослинами, заболочування. Такі явища спостерігаються найчастіше в озерах, ставках та затоках водосховищ.
Грунт ложа водойми та мул є своєрідною лабораторією, що створює живильні речовини для мешканців водойм.
